Hallo Petra,
die gute Nachricht vorweg: das geht

Du kannst dazu im Menü
Bearbeiten die Funktion
Gruppe löschen... nutzen.
Bitte unbedingt mit Kopien Deiner Daten arbeiten! Das löschen von Personen entfernt diese nämlich wirklich aus Deiner Datei.
Da Du drei Stämme erstellen willst, lohnt es sich wohl mit der Option
alles außer Auswahl herumzuexperimentieren (verbunden mit Vor- oder Nachfahren von).
Wenn die Auswahl etwas spezieller sein soll (hier und da noch ein Verwandter in der Breite mehr), lohnt es sich von Hand die Datei in Inseln nicht verbundener Personen zu trennen. Dazu benutzt man auf einer Verbindung im Eingabedialog die rechte Maustaste:
Verbindung lösen.
Leg Dir einfach mal eine Kopie Deiner Datei an und fang an mit der Funktion zu spielen und die Ergebnisse zu prüfen. Erst wenn Du Dir damit sicher bist, würde ich die endgültige Trennung vornehmen.
Bei Problemen einfach hier fragen.
Marcus